Identification of fish eggs and larvae using a novel DNA metabarcoding approach

Costa, Gabriela O.Nobile, André B.Morales, Bruno F.Rossini, Bruno C.Souza, Diogo FreitasFreitas, Érica A. SerranoOliveira, Claudio

Resumo O aumento alarmante no número de espécies ameaçadas ressalta a necessidade urgente de estratégias de conservação mais eficazes. Nesse contexto, os avanços em técnicas moleculares e em sequenciamento de alto rendimento têm sido fundamentais para fornecer abordagens mais rápidas e precisas para a avaliação da biodiversidade, em comparação com as metodologias tradicionais. A técnica de DNA metabarcoding facilita a identificação simultânea de múltiplas espécies a partir de amostras de DNA genômico, agrupadas usando primers universais. Para abordar a limitação das sequências de leitura curta, desenvolvemos um novo conjunto de primers que, em combinação com primers existentes, permite a montagem de sequências longas do gene COI por meio da sobreposição de leituras. Este estudo compara a eficácia do DNA barcoding e do metabarcoding em amostras de ictioplâncton, com foco em sua capacidade de recuperação de espécies. Usando amostras semelhantes, o DNA barcoding identificou 40 táxons, enquanto o DNA metabarcoding identificou 47 táxons. Essas descobertas destacam o potencial do DNA metabarcoding como uma abordagem robusta para a análise da comunidade ictioplanctônica, oferecendo dados abrangentes em nível de espécie, a custos reduzidos, e estabelecendo-o como uma ferramenta valiosa para iniciativas de conservação e gestão da biodiversidade.